Le unità archivistiche che compongono la serie sono numerate da XI/158 a XI/403. I numeri XI/170, XI/294 e XI/385 sono doppi.
La denominazione originaria "archivio dipartimentale" contraddistingue le buste contenenti i fascicoli degli affari trattati dall'amministrazione dipartimentale e ordinati secondo un titolario.
Da b. XI/158 a b. XI/345 si tratta di carteggio amministrativo, per gli anni 1801-1803, ordinato secondo le seguenti categorie a serie aperta: acque, annona, approvvigionamenti, archivio pubblico, biblioteche, beneficenza, beni nazionali, dipartimentale e comunali, cerceri, casa di lavoro, caserme, collegi, commerci, confini, contabilità, contribuzioni e requisizioni, coscrizione, culto, debiti e crediti, depositaria, economia, fabbriche pubbliche, feste nazionali, finanza indiretta, funzionari pubblici, gendarmeria, guardia nazionale, illumunazione notturna, impiegati, imposte dirette, imposte indirette, incendi, instituto, istruzione pubblica, legione italiana, lotto, ministero interno e monti, oggetti indeterminati, orfanotrofi, ornato, polizia, ponti, poste, prestiti regolari, sanità, scuole normali, spedali, spedali militari, spettacoli e strada di Ferrara, sussistenza e tassa d'assenza, tasse straordinarie, teatri, trasporti militari, tribunali, tumulti, università, zecca.
Da b. XI/346 a b. XI/403 si tratta di carteggio ammininistrativo, per il periodo 1803-1805, ordinato secondo le seguenti categorie a serie chiusa:acque, monti, commercio, amministrazione civile e giudiziaria, censo, magistrati e funzionari, militare, strade e fabbriche, casse pubbliche, beneficenza, spettacoli e divertimenti, popolazione, sanità, polizia, istruzione pubblica, poste, consistenza e confini dello stato, agricoltura, monumenti, monete, indeterminate.
Risulta mancante la b. XI/183. La b. XI/169 è vuota. Alcuni contenitori sono in cattivo stato di conservazione.